软腭裂手术有一定风险。但总体来说，软腭裂的手术技术非常成熟，手术本身还是比较安全的。进行软腭裂修复手术时，除了麻醉意外、咽喉部水肿等常规的潜在风险之外，最大的风险主要在于两方面，一是手术出血，二是伤口裂开甚至复裂。

1、手术出血：由于软腭裂修复手术都需要做松弛切口，而松弛切口有时会发生渗血，因此患者手术时有出血的风险。但是通常术中医生会通过有效的压迫、止血等操作，避免患者发生出血。

2、伤口裂开甚至复裂：在手术后一周左右的时间里，由于软腭的黏膜比较脆弱，因此伤口容易裂开。如果只有单层伤口裂开，不需要进行任何处理，其很快可以自然愈合；如果双层口鼻腔黏膜都裂开，则可能就会形成腭瘘，其往往需要在手术半年之后再次进行修复。

需注意，如果腭裂手术后，患者语音依然不清楚，则可能是存在继发性的腭咽闭合不全，此类患者可能需要进行二次手术治疗。