面斜裂，如同唇腭裂等其他面裂畸形一样，主要是受到遗传和环境因素的共同作用而导致的。
在遗传、物理和化学环境因素的影响下，可导致上颌突和侧鼻突之间的融合过程（包括细胞的迁移、增殖、凋亡等）发生障碍，进而形成面斜裂。临床上，羊膜囊破裂以后，形成的羊膜带或者血肿阻断了面部发育，是面斜裂产生的重要原因之一。
面斜裂是众多面裂出生缺陷中的一种，十分罕见，其发生率仅在万分之一到十万分之一。面斜裂的缺陷走形表现为，从口角经过鼻旁，再到内眦或者外眦，也可以到眶下正中区。面斜裂可以出现单纯的皮肤裂开，也可以伴发整个上颌骨，以及眶下区骨骼的缺损。
