在目前的医疗条件下，如果及时诊治，肠结核通常能治好。

1、现阶段对于结核病的治疗，已经积累了很多经验，临床提倡早期、规律、全程、适量、联合等抗结核的治疗原则，结核杆菌的治愈率通常较高。对于部分耐药的结核杆菌，目前也有较好的方法，可以达到治愈效果。

2、若肠结核的内科治疗效果不佳，还可借助外科手术治疗，切除被结核杆菌侵犯的肠管，再进行肠管通畅性的重建，可以减少肠结核对人体的不良影响。后续还可继续进行抗结核治疗，以防止结核病的复发。

所以肠结核经过消化内科、感染内科和外科等多学科的综合治疗，目前治愈率通常较高。