儿童挤眼睛需要就诊的科室，主要有眼科、心理科或神经内科。选择具体科室要根据挤眼睛的病因进行。儿童总是挤眼睛的原因比较多，可分为眼部因素和非眼部因素两大类。
1、如果是眼部因素导致的，例如倒睫、干眼症、结膜炎或角膜炎等眼部炎症都可能导致儿童频繁挤眼睛。这些情况应于眼科诊治。
2、如果是非眼部因素导致的，例如抽动症，其不属于眼部疾病，而是可能与儿童的一些不良生活习惯或者精神心理特殊状态有关。抽动症患儿处于某种精神心理状态时，可表现为频繁的眼睑抽动，可能还会伴有面部、鼻翼或口周的一些抽动。抽动症患儿应于心理科或者神经内科就医。
如果家长发现儿童总是挤眼睛，首先应到正规医院的眼科就诊。需由医生判断是否是眼部因素导致的挤眼睛，例如检查儿童是否患有倒睫、眼部炎症、干眼症等疾病。如果不是眼部因素引起的挤眼睛，则需要排查非眼部因素。例如抽动症患儿，需要就诊于心理科、神经内科等科室。