子宫内膜薄多与内分泌失调有关，在医学临床中可以采用激素去调整。此外，改善子宫血流循环也可增厚内膜。
治疗的常用药物如下：
1，激素类药物：雌激素和孕激素都可以一定程度的来增加子宫壁的厚度，从而改善子宫壁过薄的症状。常用的有雌激素类药物有戊酸雌二醇等，适用于由于雌激素分泌量过少而导致的子宫内膜薄。但用药期间应定期去医院通过做B超监测子宫内膜厚度，如有肝功能异常，应避免使用戊酸雌二醇。孕激素类的药物临床常用醋酸甲羟孕酮等，可使子宫内膜继续增厚、充血，子宫内膜腺体增生，适用于由于黄体功能不足而造成的子宫内膜薄。需要注意的是，对于已知或可疑妊娠、原因不明的阴道流血、已知或可疑患有性激素依赖性恶性肿瘤、最近6个月内患有活动性静脉或动脉血栓栓塞性疾病、严重肝及肾功能障碍、血卟啉症、耳硬化症、脑膜瘤（禁用孕激素）等患者严禁使用激素治疗。
2，乙酰水杨酸类药：常用药物有阿司匹林等，可改善局部血液循环，使子宫血流增加，起到增厚子宫内膜的作用。但服用此药可能会出现恶心、呕吐、上腹部不适或疼痛等胃肠道反应。有活动性消化道溃疡者禁用此药。
子宫内膜过薄主要影响患者的生育功能，可能导致不孕、自然流产、闭经等，需积极治疗。但患者应在专业医师的指导下用药，尽量避免自行服用药物。除了药物治疗，还可考虑行宫腔粘连松解术、子宫内膜微创术，用于促进内膜细胞增殖或再生的治疗。另外，平时要注意进行心理调节，保持积极、乐观的心态，避免不良情绪。饮食上要以豆类、谷类、薯类为主，还可以多吃黄豆、黑豆及豆制品等。