肛门闭锁术后的恢复时间无法完全确定，与手术方式有关，具体如下：

1、低位肛门闭锁患者，通过一期的直肠肛管成形术，恢复较快，术后3~5天能恢复一定进食，两周后就可以进食母乳、奶制品。

2、中高位、合并严重畸形的肛门闭锁，恢复时间很长。患者需要进行临时性造瘘，待三个月或更长时间后，再进行整形手术，有时甚至需要多次手术，恢复时间无法确定。