直径大于2cm的肾结石，病情较为复杂的肾结石，需要进行手术治疗，常可选择输尿管镜或经皮肾镜等微创治疗方案，必要时也可进行开放性手术。一般来说，只要肾结石引起了不良影响，就需要进行治疗，医生会根据患者病情，选择适当的治疗方式。
1、对于直径6mm以下的结石，如果未引起明显症状，在患者条件允许的情况下，可以尝试使其自行排出，暂不进行特殊处理。
2、对于直径6mm~2cm之间的结石，患者可选择体外冲击波碎石治疗，将结石击碎后，使其排出体外，通常不需要进行手术治疗。
3、对于直径大于2cm的肾结石或是病情较为复杂的肾结石，应该根据病情进行相应的手术治疗，手术方式包括经皮肾镜取石术、输尿管镜取石术、开放性手术等。其中经皮肾镜取石术、输尿管镜取石术对患者创伤较小，开放性手术对病情复杂的肾结石效果较好，医生会根据患者的实际情况，选择合适的手术方法。
肾结石会对机体产生危害，其严重程度与结石大小呈负相关。比如直径4mm或5mm的小结石，可能从肾脏排到输尿管中，引起严重的尿路梗阻，产生剧烈的疼痛或引起感染；而较大的结石（比如直径3cm），通常难以排到输尿管中，一般不会引起梗阻，也不会严重影响肾功能。
建议肾结石患者及时前往医院泌尿外科就诊，在医生的指导下进行治疗，以免引起不良后果。