部分卵巢透明细胞癌是由于子宫内膜异位症恶变导致的，但子宫内膜异位症的病因尚不明确，因此卵巢透明细胞癌的病因也是不明确的。

卵巢透明细胞癌的治疗和其他卵巢癌的治疗是一样的，以手术治疗为主，如肿瘤细胞减灭术等，在手术过程中要尽可能将肉眼可见的肿瘤全部切除干净。术后还需要使用紫杉醇和卡铂化疗6个疗程，并进行基因检测，再根据基因检测的结果，选择合适的靶向药物进行维持治疗，如BRCA阳性患者可以使用PARP抑制剂维持治疗。