腹泻发烧39度可能由急性肠胃炎、急性细菌性痢疾、伤寒等疾病引起，患者还可出现腹痛、恶心、呕吐、乏力等表现。
治疗腹泻发烧39度的药物主要包括：
1，退热药物：如对乙酰氨基酚或布洛芬等。对乙酰氨基酚的退热效果较好，镇痛效果较弱，因其胃肠反应较小，适合老人和儿童，但大剂量使用可能会导致肝肾功能异常，所以患者需严格遵医嘱用药。布洛芬的镇痛作用大于解热作用，需在医生的指导下使用。
2，止泻药：腹泻严重者，可给予止泻药物以缓解症状。常用药物如蒙脱石散、复方黄连素、颠茄磺苄啶片等。
3，抗生素：适用于由细菌感染引起的腹泻、发烧者，需根据药物敏感试验的结果选择相应的抗生素进行治疗，不可滥用抗生素，常用药物有头孢克洛、诺氟沙星、阿莫西林、呋喃唑酮等。
4、抗病毒药：病毒感染所致的腹泻发烧，可给予利巴韦林、阿昔洛韦等药物进行抗病毒治疗。
若经药物治疗后，体温并未下降或持续升高者，需尽快就医，以免延误病情，出现严重的并发症。必要时，可进行输液治疗。腹泻严重者，要多饮温水和淡盐水，以补充丢失的水分及电解质。