慢性根尖周炎的病因主要包括细菌感染、机械刺激、化学刺激和创伤，其中细菌感染是最主要的病原因素。慢性根尖周炎一般是由于龋病或者牙周病变治疗不及时、不彻底导致病情加重所引起的。

1、当牙髓感染坏死后，髓腔内充满大量细菌、组织残留、组织渗出物、毒素和代谢产物等，这些刺激物会造成根尖周组织的初步损伤，并通过根尖孔刺激根尖周区域，引起局部免疫反应。如果不及时去除感染源，机体免疫反应会产生较多炎症介质，进一步引起根尖周组织的破坏，形成长期慢性的根尖周炎症。

2、外力、创伤引起根尖周围组织血运障碍；或者机械刺激、热刺激等激惹根尖周组织，也可能会引起慢性根尖周炎。