龟头流脓小便刺痛多考虑由尿路感染引起，常见于尿道炎和龟头炎等疾病，需要及时到医院就诊，在专业医生指导下接受治疗。
治疗常用的药物有：
1，抗生素类药物：常用于细菌、支原体、衣原体等引起的尿路感染，通常会根据感染的病原体的类型选择合适的药物进行治疗，如淋球菌感染常用阿莫西林、头孢曲松、大观霉素等；沙眼衣原体或支原体感染常用红霉素、米诺环素等；滴虫感染常用甲硝唑、替硝唑等；大肠杆菌、链球菌和葡萄球菌感染常用左氧氟沙星等；梅毒螺旋体感染常用苄星青霉素等。
2，抗真菌药：主要用于白色念珠菌等真菌感染引起的龟头病变，常用药物有克霉唑、咪康唑、氟康唑等。
3，抗病毒药：疱疹病毒等感染常用阿昔洛韦、泛昔洛韦等药物治疗。
4，非甾体抗炎药：如对乙酰氨基酚、布洛芬等。可以缓解泌尿系统感染引起的疼痛，同时也具有一定的消炎作用。
5，止痛药：如非那吡啶。用于缓解尿路感染或刺激引起的尿道疼痛、尿道口烧灼感、尿急、尿频等不适症状。
6，其他：阿米巴导致的龟头感染可用依米丁治疗；因过敏或自身免疫引起的龟头病变可用糖皮质激素类软膏治疗，如氢化可的松、倍他米松软膏等。
出现龟头流脓、小便刺痛症状后要及时就医明确诊断，不要盲目乱用药，以防导致不良后果。治疗时要严格遵循医嘱用药，并学习药物的正确用法，以获得满意的治疗效果。部分感染可通过性行为传播，因此治疗期间应禁止性生活，且患者性伴侣应同时接受诊治，以免发生重复感染。日常多饮水、勤排尿，不要憋尿，保持排尿通畅，有利于炎症产物排出。此外，平时也应充分休息，多吃易消化、富含维生素等营养物质的食物，避免辛辣刺激性食物，注意个人卫生，保持私处清洁，适当锻炼增强体质等，也有助于促进机体恢复。
