做胎儿镜检查会对胎儿有什么影响主要取决于检查的适应证。

1、如果孕妇只是进行单纯的检查，比如判断有无白化病等，那么胎儿镜检查一般对胎儿无明显影响。但由于胎儿镜是一种有创性的操作，需将内窥镜进入到宫腔里，会对子宫产生一定的刺激，所以可能导致破水、感染、宫缩，进而造成流产。

2、如果孕妇是因为胎儿存在双胎输血综合征而进行的检查，那么还需要进行激光的手术治疗。此时可能有更多的合并症发生，还可能造成胎儿的损伤引起羊膜带综合征等，也可能导致手术失败。