唇腭裂导致的牙齿上下颌咬合关系错乱，其最重要的解决办法是唇腭裂正畸治疗。正畸治疗主要包括在术前正畸以及在乳牙期、替牙期、恒牙期等各个时期运用正畸的手段排齐牙齿，纠正好上下颌骨的关系，恢复良好的咬合关系和面部的形态。

唇腭裂患者普遍存在牙齿咬合关系错乱，由于牙骨段的连续性中断，使得牙槽骨存在移位和旋转的现象；同时口周肌肉附着异常、肌张力牵拉等，也会加重这种现象。

另外，手术、唇腭裂本身存在生长发育不足等，都会加重颌骨畸形；同时牙槽突裂隙，也会导致牙齿萌出异常、裂隙附近的牙齿存在畸形等，均会导致患者出现颌骨关系的不协调以及错颌畸形。