尽管已经经过将近50年的发展，正颌外科技术有了很大的发展，也逐渐成熟，但其依然存在较大风险，具体风险如下：

1、一般风险：包括麻醉意外、手术感染、伤口不愈合等。

2、骨块坏死：是正颌外科手术最大的风险。由于唇腭裂患者的上颌骨缺乏骨组织支撑，且存在腭部疤痕，所以上颌骨前移非常困难，还会在一定程度上影响其血供，就更容易发生骨坏死。

3、手术效果欠佳：腭部疤痕可能会牵连软组织，造成上颌骨前移存在困难，使得术后复发风险增高，造成手术后效果欠佳、咬合不良、继发面型不协调等一系列问题。