小便分叉可由多种原因引起，如前列腺炎、尿道炎、前列腺增生等，病因未明确前应避免盲目用药，以防掩盖病情，耽误治疗。
不同疾病的药物治疗如下：
1，前列腺炎：本病患者除有小便分叉表现外，还可出现尿频、尿急、尿痛等症状。医生通常会用抗生素进行治疗，如氧氟沙星等；对于疼痛严重的患者，可适当使用布洛芬等非甾体抗炎药治疗；对于肌肉痉挛引起的疼痛及排尿障碍，也可酌情应用α受体阻滞剂，如特拉唑嗪等。
2，尿道炎：本病属于上尿路感染，通常根据感染的病原体种类，选择合适的抗生素进行治疗，如一般细菌性尿道炎常用左氧氟沙星等药物治疗；淋菌性尿道炎常用头孢曲松、大观霉素等；非淋菌性尿道炎常用红霉素、氧氟沙星等；滴虫性尿道炎常用甲硝唑、替硝唑等药物。
3，前列腺增生：本病是引起老年男性排尿障碍的一种常见疾病，患者除了小便分叉以外还可出现尿频、尿急、夜尿增多等症状。常用的治疗药物包括α肾上腺素能受体阻滞剂和5α还原酶抑制剂，其中α肾上腺素能受体阻滞剂对症状较轻、前列腺增生体积较小的病人有良好的疗效，常用药物有特拉唑嗪、阿夫唑嗪等；5α还原酶抑制剂一般在服药3个月左右见效，对体积较大的前列腺增生效果较明显，与α受体阻滞剂联合治疗效果更佳，常用药物有非那雄胺和度他雄胺等。
药物治疗期间要严格遵循医嘱用药，若治疗效果不佳，还可通过手术等方法进行治疗。除上述疾病因素外，一些生理性的原因也可导致小便分叉情况发生，如夜晚尿液积聚于膀胱，引起膀胱压力过大，使早上尿液排出时的冲击力也会较大，此时尿液经过尿道口时可能会导致肌肉组织发生短时间的变形，尿液出现分叉，但一般短时间即可恢复；长时间的久坐，可能会对尿道造成挤压，导致尿道口彼此互相接触，产生轻微的黏连，此时排尿也有可能会出现小便分叉的情况。一般生理性原因引起的小便分叉不会对排尿功能产生影响，短时间内多可自行缓解，不需要特殊治疗。但若小便分叉情况长期存在，则需警惕患病可能，此时应及时去医院查明病因，然后配合医生针对相关原发病进行积极治疗。
