1、胃肠道症状：腹痛、腹泻、呕吐、食欲不振为常见的早期不良反应，严重者可出现脱水及电解质紊乱等。长期服药还可能出现严重的出血性胃肠炎或吸收不良综合征，其中吸收不良综合征可能表现为腹胀、产气、体重减轻等，发现时立即就医。
2、肌肉、周围神经病变：有近端肌无力和（或）血清肌酸磷酸激酶增高情况。患者服药后，还可能出现麻木、刺痛、无力等，需警惕，有相关症状时要就医。
3、骨髓抑制：可能引起血小板减少、中性细胞计数下降、再生障碍性贫血，甚至可能危及生命。以上可在血常规检查中判断，也可能在日常表现为突发高热、心悸、四肢无力、面色苍白等，一旦发现，及时去医院做检查。
4、休克：前期表现为少尿、血尿、抽搐、意识障碍等，都是非常严重的情况，且出现休克者死亡率是非常高的，所以一旦出现上述症状，立马就医。
5、致畸作用：曾经有长期服用秋水仙碱史的男性患者，其孩子出现了唐氏综合征（又称先天愚型），需警惕。
6、其他不良反应：秋水仙碱还可能引起脱发、皮疹、发热及肝损害等。
