鳃裂瘘管又称鳃裂瘘，是由于在胚胎发育过程中，鳃器官发育异常而导致的。

鳃裂是胚胎发育中的一个专业名词，人体胚胎发育时，头部有鳃弓，鳃弓和鳃弓之间存在裂隙，此裂隙就称为鳃裂。在人体发育过程中，如果鳃弓发育非常完全，就不会存在残余上皮。部分人在胚胎发育过程中会形成鳃裂残余，进而形成鳃裂囊肿。鳃裂囊肿如果出现先天性不闭合，就可能会形成先天性鳃裂瘘。鳃裂囊肿感染后，皮肤破溃形成瘘道，瘘道长期不愈合，也可能会形成鳃裂瘘。