取卵本身可能会造成盆腔感染、邻近器官损伤等情况，而取卵前的促排卵治疗，还可能会引发卵巢过度刺激综合征。
1、盆腔感染。由于在取卵时，医生需要使用取卵针，通过患者的阴道进入盆腔，可能会把阴道中的细菌带入盆腔，从而导致盆腔感染的发生。此时，患者可能会出现下腹疼痛、阴道分泌物增加等症状。
2、邻近器官损伤。如果医生在取卵的过程中操作不当，可能会损伤肠管、输尿管、膀胱甚至血管等器官，从而导致盆腔内出血等情况的发生。
3、卵巢过度刺激综合征。正常女性在每一个月经周期中，仅有一个卵泡成熟。临床上，为了在一个月经周期中，获得更多卵子，医生会为患者进行促排卵治疗。如果患者的卵巢对促排卵药物高度敏感，在取卵后患者可能会出现以卵巢增大、毛细血管通透性异常、异常体液外渗入第三间隙等为特征的并发症，即卵巢过度刺激综合征。