移植失败后，胚胎会被机体吸收或者排出体外。
正常状态下，胚胎移植后会先在宫腔内游走，发育成囊胚后会在宫腔内寻找合适的位置进行着床。如果胚胎没有成功着床，则表示胚胎移植失败。这些没有成功着床的胚胎无法正常发育，会被机体吸收或者随着月经排出体外。而胚胎移植失败的原因，主要与胚胎质量差、子宫内膜容受性异常有关。
1、胚胎质量差可能导致胚胎移植失败。胚胎质量差，可能与卵子或精子质量差、卵巢储备低下、女性年龄大、卵巢刺激不满意、受精方式和胚胎培养策略等因素有关。这部分人群可以尝试改变刺激方案、受精方式和培养策略，然后再次进行胚胎移植，有可能会获得质量合格的胚胎，从而获得满意的结果。
2、子宫内膜容受性异常也可能导致胚胎移植失败。子宫内膜容受性异常，可能与子宫内膜发育不良、在种植窗表达的黏附分子异常、子宫结构异常、有害的环境等因素有关。这部分人群可以在胚胎移植前尝试解决相应的异常因素。如果能够改善异常因素，则可以进行胚胎移植，从而获得满意的结果。