卵巢性闭经是由于卵巢本身原因所引起的闭经，可能与早发性卵巢功能不全、多囊卵巢综合征、Turner综合征、先天性性腺发育不全、功能性卵巢肿瘤等疾病有关。
1、早发性卵巢功能不全。本病可由遗传、自身免疫性疾病等因素引起，这些因素会影响卵巢的正常功能，进而导致正常的月经无法形成，从而引发卵巢性闭经。
2、多囊卵巢综合征。本病患者的卵巢与正常卵巢的结构、功能存在差异，会出现月经及排卵异常、代谢异常、不孕、高雄激素等表现，也会引发卵巢性闭经。
3、Turner综合征。本病又称先天性卵巢发育不全症，患者的卵巢无法正常发育完全，不能执行正常的卵巢功能，因此会引发卵巢性闭经。
4、其他疾病。先天性性腺发育不全、功能性卵巢肿瘤等疾病，也会影响卵巢的功能，进而影响月经的正常形成，最终引发卵巢性闭经。