卵巢性闭经是指卵巢原因所引起的闭经，包括早发性卵巢功能不全、Turner综合征、先天性性腺发育不全、多囊卵巢综合征、功能性卵巢肿瘤等。卵巢性闭经的治疗，主要是针对具体的原因进行相应的治疗。
1、对于早发性卵巢功能不全、Turner综合征、先天性性腺发育不全等原因导致的卵巢功能过早衰竭而造成的闭经，由于长期雌激素水平低下，会出现围绝经期的症状，且患者心血管疾病发生风险增加，所以这部分患者以综合治疗为主，特别需要在医生的指导下服用激素替代治疗的药物，以纠正长期低雌激素所带来的影响。
2、对于多囊卵巢综合征导致的慢性无排卵而造成的闭经，如果患者有生育需求，则以恢复排卵为主要治疗目的，可以使用促性腺激素、来曲唑等药物进行治疗。如果患者没有生育需求，则可以在医生的指导下口服低剂量的避孕药进行治疗，或者口服黄体酮，通过撤退性出血，从而达到保护子宫内膜、改善异常激素环境的目的。
3、对于功能性卵巢肿瘤导致的卵巢性闭经，多须进行手术治疗。