引起脂肪泻的原因主要有以下两个方面：
1、胰腺疾病。
胰腺疾病是引起脂肪泻最常见的原因。胰腺最主要的功能是分泌消化酶，包括脂肪酶、蛋白酶、淀粉酶等，而脂肪的消化和吸收主要是依赖于胰腺分泌的脂肪酶。所以如果发生慢性胰腺炎、胰腺肿瘤等胰腺疾病，导致胰腺功能下降，会使胰腺无法分泌足够的脂肪酶来辅助脂肪消化，则部分脂肪不能被消化，也不能被吸收，最终随着大便排出体外，形成脂肪泻。
2、小肠病变。
因为机体消化和吸收的场所都在小肠，所以任何小肠黏膜的损伤、病变，都可能会妨碍脂肪的吸收，导致不能被吸收的脂肪随粪便排出，引起脂肪泻。