射精后小腹疼痛的原因主要包括以下两种：
1、慢性前列腺炎。慢性前列腺炎患者可有骨盆区域疼痛及尿急、尿频、尿痛、夜尿增多等排尿异常症状。射精过程发生前列腺充血时，可能加重前列腺炎的相关症状，造成射精后出现下腹部疼痛。此时，疼痛比较轻微、隐蔽，可在转移注意力后明显减轻，甚至感受不到。
2、泌尿系统结石。性交是一种剧烈的身体运动，可能使位于膀胱或尿道的结石发生活动，局部的肌肉紧张也可能造成结石活动，导致局部疼痛。此时，疼痛多为绞痛，程度较严重，不受情绪的影响。
所以，出现射精后小腹疼痛的患者应在医生的指导下，根据疼痛的特点判断病因，并进行相应治疗。
