预防胎儿大脑发育不良，孕妇应该避免感染，做好产前诊断，并及时补充叶酸。
1、避免感染。由于病毒、弓形虫等感染会导致胎儿大脑发育不良，所以孕妇应该避免接触宠物，同时要避免吃生食，如生肉等，以免感染弓形虫；还应该尽量避免接触病毒感染患者，以免发生巨细胞病毒感染。
2、做好产前诊断。对于高龄产妇，或者以前有过家族遗传史、不良生育史、反复自然流产、胎停育等情况的孕妇，应该进行唐氏筛查等产前诊断，以发现21-三体综合征等疾病，及时终止妊娠，避免大脑发育不良的胎儿出生。
3、及时补充叶酸。从怀孕前三个月开始，一直到怀孕后第三个月，孕妇要口服小剂量叶酸，以免由于叶酸缺乏，导致胎儿神经管畸形。
需要注意的是，对于由胎儿宫内缺氧，或者更加罕见的染色体和基因异常导致的大脑发育不良，一般难以预防。