新生儿低血糖缺乏特异性临床表现，大多数患儿都表现为无症状性低血糖。少数患儿会出现非特异性的临床症状，如面色苍白、出汗较多、反应低下等。如果病情比较严重，还可能会出现淡漠、嗜睡、异常哭声、哭声弱、纳奶差、喂养困难、肌张力低下等症状。部分患儿还会出现颤抖（四肢抖动）、低体温（体温低于36℃）、呼吸不规则、呼吸暂停、全身皮肤青紫等。如果病情非常严重，还可能会出现惊厥、昏迷等。