人工耳蜗植入手术通常没有太大的风险。因为此种手术较少出现并发症，且相关并发症并不严重。如果手术的外科医生经验比较丰富，一般会很容易处理手术的并发症。人工耳蜗植入手术可能出现的并发症，包括术后感染、面瘫、皮瓣坏死、眩晕、埋植部件故障等。
1、术后感染：极少见。但如果感染累及埋植部件，后者可能导致机体产生异物排斥反应，此时一般需要取出埋植部件才可治愈感染。
2、面瘫：一般都能完全恢复。
3、皮瓣坏死：多因皮瓣供血不良引起。临床上，针对此种情况，医生会在设计皮瓣时，保留皮瓣主要的动脉。
4、眩晕：常在术后早期出现，一般在数日后逐渐恢复。
5、埋植部件故障：如接收/刺激器电路故障、电极破损而短路、电极脱出等，但此种情况极罕见。