由于耳朵流脓通常是因外耳道疖、外耳道炎等疾病引起的，所以患者应该挂耳鼻喉科。临床上，医生会通过相关检查明确引起耳朵流脓的原因，并根据具体情况，进行针对性的治疗。
1、如果是由于外耳道疖破溃所引起的耳朵流脓，则医生会先用3%的过氧化氢溶液将脓液清洗干净，必要时医生还会在脓腔放置引流条，以保持引流通畅。随后，医生会给予患者抗生素，如青霉素或大环内酯类抗生素，以预防感染。
2、如果是由于外耳道炎所引起的耳朵流脓，则医生会先清理外耳道的脓液，以保证局部清洁、干燥和引流通畅。随后，医生会根据细菌培养和药物敏感试验的结果，给予患者敏感的抗生素，如头孢菌素类抗生素，以控制感染。另外，对于伴有外耳道红肿的患者，医生会局部敷用含有鱼石脂甘油的纱条。