卡培他滨片副作用较大，卡培他滨在肿瘤的治疗过程中，非常常见（发生率大于等于10%）的副作用包括厌食、腹泻、呕吐、恶心、口腔炎、腹痛、手-足综合征、皮炎、疲劳、困倦等。
常见（发生率大于等于5%，小于10%）的副作用包括脱水、食欲低下、感觉异常、味觉异常、头痛、头晕、流泪增多、结膜炎、便秘、上腹痛、消化不良、高胆红素血症、皮疹、脱发、红斑、皮肤干燥、发热、无力、乏力等。
还有一些发生率较低的不良反应，如食管炎、胃炎、下肢水肿、心肌病、呼吸困难、抑郁等。
手-足综合征：一种皮肤毒性，表现为麻木、感觉迟钝、感觉异常、皲裂、硬结样水泡或严重的疼痛等。持续或严重的手-足综合征可能最终导致患者失去指纹。