儿童角膜炎的治疗时间从数天到数月不等，主要取决于引起儿童角膜炎的病因、病情的严重程度、患者的抵抗能力以及治疗是否及时、规范等，部分患者还可能会迁延不愈或者反复发作。儿童角膜炎的治疗方法包括药物治疗和手术治疗两种。
1、药物治疗。对于儿童角膜炎的治疗，首先应该明确致病菌的类型，然后根据不同的病原体选择合适的抗感染药物。常用的药物有抗生素、抗病毒药物、抗真菌药物等，一般采用眼药水滴眼的方式用药，病情严重时还可口服或者静脉给药。除上述药物之外，患者还可联合应用角膜修复药物、散瞳药物或激素类药物。
2、手术治疗。如果儿童角膜炎患者通过药物治疗效果不佳，或者发生角膜穿孔等情况，则需要进行角膜移植等手术治疗，以使患者的视力得到一定恢复。