空毛囊是指毛发结构缺失，毛囊的中间是一个空腔。
毛囊是产生毛发的微器官，位于表皮、真皮和皮下脂肪层。头皮的毛囊长度约为4~5毫米，毛囊末端膨大，称为毛球，毛球内的细胞会逐渐分化、增殖，产生毛发，毛发在毛囊内的部分称为毛根。如果毛发结构缺失，毛囊的中间只剩一个空腔，则称为空毛囊。导致空毛囊的原因包括生理性原因、病理性原因以及人为原因等。
1、生理性原因。毛囊呈周期性变化，生长期毛囊最长，下端毛球会产生新的毛发，毛发每天增长的速度是0.3毫米。一定时间后，毛球内细胞的增殖、分裂能力耗尽，进入退行期或休止期，毛囊下部消失，毛根变短，毛发容易在外力作用下脱落，形成空毛囊。一般3个月左右，会进入下一个生长期，有新的毛发产生，将空毛囊填满。
2、病理性原因。某些疾病会导致毛囊的休止期延长，迟迟不能进入下一个生长期，空毛囊就会持续存在，常见原因有雄激素性秃发（俗称脂溢性脱发）、休止期脱发和斑秃等。
3、人为原因。如果患有拔毛癖，会将某一区域内的毛发从毛囊内拔出，导致生长期内的毛囊提前进入休止期，从而造成空毛囊的产生。