手术治疗后还会有肾积水的原因是手术不能完全消除肾积水。部分患者肾积水的病情较为复杂（如复杂的输尿管修复者），很难通过手术彻底清除肾脏积水，只能缓解病情、改善症状。肾积水手术治疗的主要目的为保护肾功能、预防并发症（如结石、感染等）、防止结构损害。在达到上述治疗预期的情况下，即使积水未彻底清除，也可以认为获得临床治愈。例如行肾造瘘手术后，体内有支架管的患者，在支架管拔除后，症状未加重、肾功能未恶化，基本恢复至正常人的生活，一般认为达到临床治愈。因此，即使术后仍有肾积水，但去除了体内的支架管，保护了肾功能，消除了输尿管梗阻的症状，也不一定意味着治疗无效或失败。