儿童牙龈肿痛能否自愈主要取决于具体原因。

1、如果在牙齿萌出过程中，牙龈组织覆盖在牙齿表面形成盲袋，就可能会引起萌出性牙龈炎，导致牙龈肿痛，这种情况患儿要认真进行口腔清洁。一般来说，当牙齿萌出后，盲袋可自行消失，牙龈肿痛就会自愈。

2、多数情况下，儿童牙龈肿痛是由于根尖周炎或者牙周感染导致的，如果不进行相应的治疗，牙龈肿痛是不会自愈的。

因此，如果儿童出现牙龈肿痛，要及时去医院就诊，明确病因，并采取针对性治疗，避免牙龈肿痛再次发生。