胃旁路手术可能会存在一定的副作用，包括吻合口瘘、肠梗阻、营养不良等。
1、吻合口瘘。胃旁路手术的早期，可能会出现吻合口瘘，导致胃肠道出血或者消化液流到腹腔当中，严重者甚至会引起腹腔感染。
2、肠梗阻。如果胃旁路手术后，胃肠吻合口处出现疤痕增生，可能会导致吻合口处狭窄，严重者会引起肠梗阻，患者会出现恶心、呕吐、腹痛、腹胀、排泄受阻等症状。
3、营养不良。胃旁路手术将胃与肠道直接连接，会破坏正常消化道的生理结构，导致胃容量变小，不利于机体对营养物质的吸收。由于长期的营养吸收障碍，可能会造成机体出现营养不良的症状，如贫血、低蛋白血症、低血糖等。
需要注意的是，很多肥胖症患者合并有高血压、糖尿病、呼吸功能障碍、心功能障碍、肝功能异常、凝血机制异常等一系列并发症，这些都会增加手术的风险，严重时甚至会危及患者的生命。
因此，在进行胃旁路手术之前，一定要对患者进行评估，可以在一定程度上降低术后并发症的风险。对于重度肥胖患者，可以先进行饮食、药物、行为等治疗，或者先进行袖状胃切除手术，等风险降低以后，再择期进行胃旁路手术。