儿童肥胖应该就诊于内分泌科。

1、儿童肥胖主要由肥胖生殖性无能综合征、柯兴综合征等病理性因素，和营养性因素所导致，这些因素都与内分泌有关。

2、儿童肥胖会造成高脂血症、糖尿病等疾病，这些疾病也都是内分泌相关的疾病。

所以，儿童肥胖应就诊于内分泌科。