清胃黄连丸具有清胃泻火、解毒消肿的功效，用于治疗肺胃火盛引起的口舌生疮、牙龈红肿胀痛、咽喉肿痛。现代研究表明，本品主要有促进胃肠道运动、解热、抗炎、抗病毒和镇痛等药理作用，可在医生的指导下用本品治疗西医上的咽喉炎、扁桃体炎、口腔炎、牙周炎等疾病。
本品为中药复方制剂，主要由黄连、石膏、黄芩、黄柏等中药组成。其中黄连、石膏清胃泻火，为君药。黄芩、栀子清热燥湿、泻火解毒，为臣药。连翘清热解毒消肿；知母、黄柏、玄参、地黄滋阴降火、燥湿凉血；牡丹皮、赤芍凉血活血、清热消肿；天花粉养阴润燥、清热生津，共为佐药。桔梗、甘草解毒利咽，且桔梗载药上行，甘草调和诸药，为佐使药。以上药物合用，共同发挥清胃泻火、解毒消肿的功效。