在孕期如果发现胎儿存在有肾囊肿，应通过B超进行密切监测。除了观察肾囊肿的大小是否有变化外，还要观察是否有其他伴发的异常。如果囊肿增长比较快，对肾脏实质构成了压迫，可以采取对症处置；如果肾脏囊肿对于胎儿的肾脏发育，没有构成很大的危害，胎儿的羊水量也正常，则可以等出生以后再进行处理。

需注意，如果通过基因诊断，确诊是婴儿型多囊肾，则肾脏可以表现为B超下多个小囊泡或者单纯的肾脏回声增强。如果属于婴儿型多囊肾，因为其预后不好，通常建议及早终止妊娠。