冷冻治疗跖疣的原理就是通过液氮把跖疣的活体组织冻死、使组织失去生命、重新长出新肉的过程。这种冷冻的效果主要看具体操作大夫的经验，如果冷冻太深，容易损伤正常组织，愈合就会减慢；如果伤及周边组织，就容易出现水肿和其它不适；如果冷冻太浅，跖疣就不容易彻底清除，有可能再次复发起水泡、发痒。
若跖疣冷冻几次都好不了，建议患者首先及时跟主治医生进行沟通，调整冷冻深浅。如果治疗效果还是不尽人意，则可考虑改用药物治疗、物理治疗或手术治疗等方式进行干预，同时患者还应注意日常调护。
1、药物治疗：部分跖疣患者在冷冻多次后，如果效果均不明显，可给予外用药物治疗。常用药物包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，以提高局部免疫力，减少病毒感染的机会。
2、激光治疗：如果跖疣较多、较大，经反复冷冻治疗效果不明显，可改用激光治疗。医生通常会根据患者的皮损情况，决定治疗的次数。
3、光动力治疗：部分较为隐蔽的疣体，不适合激光治疗，可考虑光动力治疗。医生会将一种光敏剂涂在疣体处，以便更好地显示疣体分布，利于光照将疣体破坏，从而去除疣体。
4、手术治疗：对于药物治疗、物理治疗等无法去除的跖疣，可选择外科手术治疗，比如钝性剥离法等，以去除疣体。
需要注意的是，在治疗的同时，患者应进行日常调护，比如进行户外运动、养成良好的生活习惯、注意劳逸结合、保持均衡营养等，以增加自身免疫力，避免跖疣反复发作。