环丙沙星可治疗敏感菌引起的各种感染，如生殖系统感染、呼吸道感染、皮肤感染、眼部感染等。环丙沙星剂型多样，引起的副作用也相应不同。
1、胃肠道反应：较常见腹部不适、腹痛、腹泻、恶心、呕吐。
2、中枢神经系统反应：包括头昏、头痛、嗜睡、失眠，还有癫痫、精神异常、烦躁不安、意识混乱、幻觉等严重的，要及时就医。
3、肾功能异常：表现为血尿、结晶尿、腰痛、突感疲乏等。
4、骨骼肌肉系统反应：包括关节痛、肌痛、肌无力、张力亢进肌腱炎、肌腱断裂、重症肌无力恶化，为了防止症状更加严重，要及时就医。
5、心血管系统反应：包括心动过速、室性心律失常。
6、周围神经病变：部分患者出现感觉错乱、感觉迟钝、触物痛感、疼痛、烧灼感、麻刺感、麻木、无力，或轻触觉、痛觉、温度觉、位置觉和振动觉异常、多发性神经炎。
7、血液系统异常：药物可能引起贫血、血小板减少症、包括血栓性血小板减少性紫癜、白细胞减少症、粒细胞减少症、全血细胞减少症和/或其他血液病。日常可能表现为面色苍白、异常出血、四肢无力、食欲不振、昏厥、心悸等，一旦出现要及时就医检查。
8、其他的不良反应：环丙沙星还可能引起发烧、血管炎、血清病、难辨梭菌相关性腹泻、血糖紊乱等。
外用环丙沙星有局部刺激性，偶尔出现轻微刺痛感。有时还会发生过敏反应，表现为皮疹、瘙痒、渗出性红斑、血管神经性水肿等，发现过敏要及时停药就医。
眼用环丙沙星主要有局部的、短暂的刺激性症状，如灼烧感、异物感。此外还可能引起眼睑水肿、流泪、畏光、视力减低等。很少引起过敏反应。
耳部用环丙沙星滴耳液偶尔引起中耳痛及瘙痒感。
偶尔引起局部刺激反应或过敏反应，可能表现为刺激感、阴道瘙痒、红肿等。
1、用药前向医生详细描述自己的特殊过敏史、身体状况、基础疾病以及近期用药情况等，排除用药禁忌，避免出现严重用药风险。对环丙沙星或其它任何喹诺酮类药有过敏史的患者，禁用该药；周围神经病变病史患者、重症肌无力患者等也禁用。
2、环丙沙星有致儿童关节病变的风险，所以孕妇和18岁以下儿童不宜服；哺乳期妇女服药期间最好停止哺乳。
3、服用环丙沙星期间，最好避免过度暴露于光源下，选择适合的防晒衣物或防晒品。因为药物使患者更容易出现晒伤反应，如烧灼感、红斑、水泡、渗出、水肿等。
4、服用环丙沙星期间，宜多多饮水，可避免药物导致的结晶尿的发生，最好保持24小时排尿量在1200ml以上。
5、糖尿病患者服用环丙沙星期间，应该接受密切的血糖监测，防止药物导致的低血糖，引起的昏厥等危险症状。
6、使用环丙沙星滴耳液时，最好使药液温度保持在与体温相近，如果温度过低时使用，可能会使你眩晕。
7、用环丙沙星如果出现过敏情况，要立即停药就医，过敏有致死风险。
8、使用阴道用环丙沙星的栓剂或泡腾片时，保持手部的清洁与干燥，以防阴道出现新的感染。
9、服药期间出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时就医。