儿童鹅口疮可通过药物进行治疗。但是，因为儿童群体的特殊性，一般不会选择让儿童口服或者含服用药，而是让家长帮助其涂抹用药。

例如，如果患儿需要含漱碳酸氢钠溶液，一般会让家长用棉签蘸碳酸氢钠溶液擦拭口腔内有白色绒膜的位置；如果患儿需要使用制霉菌素片进行治疗，一般会让家长将药物化在5ml的凉开水里，大概一勺水左右，然后用棉签蘸着药水擦拭口腔内有白色绒膜的位置进行治疗。