根分叉病变的危害主要包括加速牙齿的丧失以及反复肿胀。
1、加速牙齿的丧失。根分叉病变是牙周炎发展到一定程度的结果，部分患者的根尖病变左右串通，形成了隧道，可以用间隙刷控制菌斑，但是若根分叉病变被牙龈掩盖，就会导致菌斑控制难度加大，而菌斑控制不佳，就会加速牙齿的丧失。
2、反复肿胀。根分叉病变可能导致局部肿胀，经过治疗局部的菌斑能得到有效地控制，肿胀可缓解。但若此后不注意自我的菌斑控制，一般三个月过后，细菌可能会反跳到原来的水平，导致再次出现局部的肿胀。
需要注意的是，只要菌斑存在，牙周疾病就存在进一步恶化的可能，就可能导致根分叉病变。当出现根分叉病变后，患者需要及时就诊，积极地进行治疗来消除病变，为控制菌斑创造良好的条件，避免病情进一步恶化。
