氧氟沙星用于敏感菌所致的泌尿、生殖、呼吸道、消化道、皮肤、软组织等的感染。其药用部位不同，副作用也不同。
1、胃肠道反应：包括腹部不适或疼痛、腹泻、恶心或呕吐。
2、中枢神经系统反应：可有头昏、头痛、嗜睡或失眠。
3、过敏反应：主要表现为皮疹、皮肤瘙痒。偶可发生渗出性多形性红斑及血管神经性水肿。较少见光敏性，即对光敏感，容易晒伤，需注意。
4、精神疾病：包括癫痫发作、精神异常、烦躁不安、意识混乱、幻觉、震颤等。
5、实验室指标异常：少数患者可发生血清氨基转移酶升高、血尿素氮增高及周围血象白细胞降低,
6、其他不良反应：部分患者出现血尿、发热、皮疹等间质性肾炎表现。注射者还可能出现静脉炎、关节疼痛、结晶尿（多见于高剂量应用时）。
偶有中耳痛及瘙痒感。
偶有暂时的刺激症状，表现为眼睛灼热、眼痛或不适、畏光、咽炎，一般不影响用药。还罕见过敏、眼睑水肿、眼睛干燥及瘙痒。
目前氧氟沙星凝胶的不良反应尚不明确。
1、偶有轻微刺激感，但不影响继续治疗和疗效。
2、过敏反应：表现为皮疹和皮肤瘙痒，偶可发生渗出性多形性红斑及血管神经性水肿。
1、氧氟沙星应在医生指导下使用。用药前应仔细阅读说明书，了解药物的使用方法、不良反应、禁忌等，需要使用其他药物的患者应该与医生说明用药情况，避免出现联合用药风险。
2、为避免结晶尿的发生，建议你用药期间需要多饮水，多排尿。
3、口服氧氟沙星治疗期间，应避免过度暴露于阳光下。建议出门时打伞、戴宽檐帽、穿防晒衣、涂抹防晒等。如果发生光敏反应，皮肤出现异常，需停药，并及时咨询医生或就医。
4、氧氟沙星凝胶和乳膏为皮肤外用药，使用时避免接触眼睛或其他黏膜，如口、鼻等。
5、氧氟沙星滴眼液仅限于滴眼，不能用于结膜下注射，也不能口服。使用时，容器的前端不应接触眼睛或其他地方，避免污染。
6、氧氟沙星滴耳液仅用于滴耳，使用时如果药温过低，可能会引起眩晕，所以应在药温接近体温时使用。使用氧氟沙星滴耳液治疗的疗程以4周为限，如果4周还未达到预期效果，也不可以自行延长用药，应及时咨询医生。
7、和其他抗感染药一样，延长使用氧氟沙星将可能导致非敏感微生物的过度生长，导致新的感染，因此不应长期应用本品。
8、用药期间出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时咨询医生或就医。