磷酸奥司他韦颗粒用于治疗甲型和乙型流感，也可用于预防甲型和乙型流感。常见的不良反应为呕吐、恶心，一般持续时间短暂，不影响继续服药。
1、胃肠道反应：包括恶心、呕吐、腹痛、腹泻、消化不良等症状。
2、皮肤和皮下组织改变：极少数患者出现严重的皮肤反应，如中毒性表皮坏死、Stevens-Johnson综合征、多形性红斑、发红（皮疹）、皮炎和大疱疹。
3、肝脏和胆道异常：极少数有流感样疾病的患者出现了肝炎和肝酶升高。
4、其他不良反应：部分患者容易出现失眠、头晕、乏力、咳嗽、流涕、哮喘、鼻衄、耳痛，还可出现上呼吸道感染、结膜炎、中耳炎、肺炎、鼻窦炎、支气管炎、皮炎、淋巴结肿大等。个别患者出现胰腺炎、血管性水肿、喉部水肿、支气管痉挛、面部水脚。
1、磷酸奥司他韦颗粒应在医生指导下使用。用药前应仔细阅读说明书，了解药物的使用方法、不良反应、禁忌等。需要使用其他药物的患者，应该与医生说明用药情况，避免出现联合用药风险。
2、只有当潜在益处大于风险时，妊娠期和哺乳期妇女才可以使用本品治疗，哺乳期妇女服药期间应暂停哺乳。
3、服用磷酸奥司他韦颗粒治疗的患者，曾发生自我伤害和谵妄事件，所以用药期间应密切观察患者的精神状况，尤其是儿童，当出现异常时，应及时咨询医生或就医。
4、磷酸奥司他韦对流感的预防作用仅在用药时才具有，所以磷酸奥司他韦不能取代流感疫苗。
5、流感本身所带来的乏力、头痛、头晕等症状，可能影响操作能力，所以患者应谨慎驾驶和操作机械等。
6、治疗期间出现任何严重、持续或进展性的症状，应及时咨询医生或就医。