1、免疫系统异常：罕见严重过敏反应，可能包括水肿、支气管痉挛、红斑和低血压。
2、精神异常：罕见在恢复阶段出现欣快感和性抑制解除感。
3、神经系统异常：在麻醉诱导过程中，常可出现自发运动和肌肉的阵发性痉挛。还可能出现肌张力障碍和其它不自主运动。罕见在恢复阶段出现头疼、晕眩、寒战及冷感、癫痫样抽搐，包括角弓反张。个别患者会出现迟发性癫痫样发作，延迟时间可为几小时到几天，个别癫痫患者在使用丙泊酚后还会有抽搐反应。
4、心脏和循环系统异常：常见轻度或中度低血压。罕见恢复期心律不齐，以及在全身麻醉过程中，出现逐渐加重的心动过缓（直到心脏停搏）。
5、呼吸系统、胸廓及纵隔异常：在麻醉诱导期间常出现过度通气、呼吸暂停和咳嗽，也可能在麻醉维持期间或恢复期出现咳嗽。个别患者会出现肺水肿。
6、胃肠道反应：常见在麻醉诱导期出现呃逆，罕见在恢复期出现恶心或呕吐，非常罕见胰腺炎。
7、肾及泌尿系统异常：罕见长时间应用丙泊酚后出现尿变色。
8、全身性症状：常见诱导麻醉后出现皮肤发热潮红。罕见术后发热。极个别重症监护室患者出现横纹肌溶解、代谢性酸中毒、高钾血症或者心力衰竭，有时会造成致命的后果。
9、给药部位症状：在最初注射时常见局部疼痛。罕见血栓和静脉炎。
