1、胃肠道反应：部分患者可出现食欲减退、恶心、呕吐、腹泻及腹部痉挛等症状。
2、精神神经系统异常：长期用药可出现异常兴奋、情绪改变、梦魇、精神障碍、头痛、头晕、眩晕、耳鸣、眼球震颤、神经性耳聋、惊厥、肢体运动协调障碍等。
3、肌肉骨骼系统异常：长期用药可出现眼外肌麻痹、骨骼肌无力、腱反射消失或减退等。
4、眼部异常：羟氯喹可引起视觉及角膜改变，较常见视觉模糊、光晕、光过敏。如果出现任何不明原因的视觉灵敏度、视野异常，或视觉症状（如眼前闪光和划线），要立即前往医院检查。
5、皮肤异常：部分患者可出现白发、脱发、瘙痒、皮肤及黏膜色素沉着、皮疹（荨麻疹、麻疹样皮疹、苔藓样皮疹、斑丘疹、紫癜、离心性环形红斑和剥脱性皮炎）等。
6、血液系统异常：有的人可出现再生障碍性贫血、粒细胞缺乏、血小板减少、溶血。
7、过敏反应：部分患者可出现皮疹，如果曾经由于服药发生过皮疹，需要引起注意。还可能出现荨麻疹、血管性水肿和支气管痉挛。出现过敏反应要立即停药就医。
8、其他不良反应：可能出现体重下降、倦怠、卟啉病和非光敏感的银屑病病情恶化。
