对于胃酸过多引起的症状（如胃痛、胃灼热、反酸）的治疗，铝镁混悬液的治疗效果可能会比硫糖铝混悬液效果好一些。两者都具有中和胃酸的作用，但硫糖铝主要起黏膜保护作用，抗酸方面作用相对弱一些。而铝镁混悬液属于抗酸药，主要就是针对胃酸过多引起的疾病或症状。
但对于消化性溃疡的治疗，两者的“专业性”就反过来了。硫糖铝可与胃肠道中溃疡或炎症处相结合，形成一层保护膜，促进溃疡的愈合并使其免受更多的伤害，还能促进内源性前列腺素合成和表皮生长因子的吸附，利于溃疡和炎症处的黏膜再生。而铝镁混悬液只对因胆汁返流引起的胃溃疡有一定的作用。