小三阳者是否存在临床症状，需视情况而定，其主要取决于小三阳的类型。小三阳主要包括乙肝小三阳携带和乙肝小三阳肝炎两种类型。
1、对于大多数小三阳患者而言，主要处于乙肝小三阳携带状态，又称为非活动性乙肝表面抗原携带状态，患者处于免疫控制期，乙肝DNA复制不活跃，病情处于相对稳定期，患者一般无明显症状。
2、对于小部分小三阳患者而言，主要处于乙肝小三阳肝炎状态，又称为乙肝e抗原阴性慢性乙肝，患者处于再活动期，乙肝DNA复制较为活跃，常见症状包括乏力、食欲不振、恶心、呕吐、右上腹不适、皮肤巩膜黄染、尿液发黄、嗜睡等。
需要强调的是，乙肝小三阳肝炎难以辨别，往往病情容易被忽视，相对于大三阳肝炎，其更容易发展为肝硬化、肝癌，所以小三阳者应定期进行监测，及时发现病情变化，以便医生根据患者情况调整治疗方案。