男性淋病以药物治疗为主，首选药物为头孢曲松、大观霉素等抗生素，这些药物的疗效通常比较好，不易出现耐药的情况。临床上，医生会根据患者病情的不同，制定出不同的用药方案，且遵循及时、足量、规则用药的原则。另外，在治疗后，患者还应该定期到医院复查，以观察判断治疗的疗效。
需要注意的是，如果患者对某种抗生素过敏，则应该提前告知医生；男性淋病患者的配偶携带淋病奈瑟菌（引起淋病的病原体）的可能性较大，如果未能及时到医院检查、治疗，即使男性淋病患者获得治愈，也可能在性接触的过程中再次感染淋病奈瑟菌，故淋病通常需要夫妻同治。