肩袖损伤手术是否有后遗症，需视具体情况而定。肩袖大型撕裂，非手术治疗无效的中小型肩袖撕裂，以及合并存在肩峰下撞击因素的病例一般采用手术治疗。
1、如果患者肩袖撕裂属于轻中度，采用合理的手术修复方式，术后患者也能够严格遵医嘱进行治疗及康复训练，那么此类患者的治疗效果一般较理想，且预后情况较好，一般不会出现后遗症。
2、如果患者肩袖撕裂属于较大或巨大撕裂伤，手术修补的失败率则比较高，特别是存在预后不良因素者，比如年龄较大、营养状况较差、手术修复方式不合理、吸烟以及患有骨质疏松、糖尿病等基础疾病，可能影响手术恢复效果，因此术后发生关节粘连、僵硬、疼痛、术后功能恢复不满意、再撕裂等后遗症也较多存在，影响肩关节功能的恢复。