眼氨肽滴眼液是处方类药物，必须在医生的指导下使用，具体的用药剂量、频次和疗程，需要由专业医生判断，请患者不要擅自停药或者延长用药时间。使用前，患者首先要清洗双手，因为不洁的双手可能携带细菌微生物，造成眼部的感染。使用时可以用手指轻轻扒开下眼皮，将适量的滴眼液滴于泪囊旁，然后合上眼并转动眼球，帮助药物均匀分布。
需要注意的是，使用时管口不要接触到眼睑皮肤及睫毛，以免污染滴眼液，用完后及时密封保存。本品开启使用时应用签字笔标记开启时间，10天后即使没有用完，也必须丢弃残留的滴眼液，以免使用后出现眼部感染。使用过程中也要时刻关注滴眼液的情况，若滴眼液出现浑浊，即不能使用。