大三阳和小三阳是一个通俗的说法，不是专业的说法，两者的区别主要体现在定义不同、传染性不同、病程分期不同三个方面。
1、定义不同。大三阳是指乙肝表面抗原、乙肝e抗原和乙肝核心抗体同时阳性，为乙肝病毒完整存在的经典模式；小三阳是指乙肝表面抗原、乙肝e抗体和乙肝核心抗体同时阳性，为乙肝病毒大三阳转变后的形式。
2、传染性不同。大三阳患者体内乙肝病毒复制十分活跃，传染性较强；小三阳患者通常体内病毒载量较低，传染性相对较弱。
3、病程分期不同。大三阳、小三阳虽然都包括慢性携带状态和慢性乙肝两种类型，但所处临床分期不同。其中，大三阳携带状态处于免疫耐受期，大三阳肝炎处于免疫清除期；小三阳携带处于免疫控制期，小三阳肝炎处于再活动期。
需要强调的是，大三阳和小三阳只是反映了乙肝患者的免疫学状态，并不能单纯通过大三阳和小三阳来判断病情的严重程度，而应结合肝功能、乙肝DNA、腹部超声等综合分析，及时发现病情变化，以便调整治疗方案。